Публикации

2021

1. Dempwolff A.L., Belogolova A.M., Trofimov A.B., Dreuw A. / Intermediate state representation approach to physical properties of molecular electron-attached states: Theory, implementation, and benchmarking // J. Chem. Phys. - 2021 - V. 154, N. 10, P. 104117(1-16) - DOI: 10.1063/5.0043337
2. Dempwolff A.L., Belogolova A.M., Sommerfeld T., Trofimov A.B., Dreuw A. / CAP/EA-ADC method for metastable anions: Computational aspects and application to π* resonances of norbornadiene and 1,4-cyclohexadiene // J. Chem. Phys. - 2021 - V. 155, N. 5, P. 054103(1-13) - DOI: 10.1063/5.0057737
3. Duran A.T., Powis I., Holland D.M.P., Nicolas C., Bozek J., Trofimov A.B., Grigoricheva E.K., Skitnevskaya A.D. / Vibronic interaction in trans-dichloroethene studied by vibration- A nd angle-resolved photoelectron spectroscopy using 19-90 eV photon energy // J. Chem. Phys. - 2021 - V. 154, N. 9, P. 094303(1-19) - DOI: 10.1063/5.0040049
4. Hill A. , Sa’adeh H., Cameron D., Wang F., Trofimov A.B., Larionova E.Yu., Richter R., Prince K.C. / Positional and Conformational Isomerism in Hydroxybenzoic Acid: A Core-Level Study and Comparison with Phenol and Benzoic Acid // J. Phys. Chem. A - 2021 - N. 125, p.9877−9891 - DOI: 10.1021/acs.jpca.1c07523
5. Orel V.B., Vitkovskaya N.M., Bobkov A.S., Semenova N.V., Schmidt E.Y., Trofimov B.A. / Aldol Condensation Versus Superbase-Catalyzed Addition of Ketones to Acetylenes: A Quantum-Chemical and Experimental Study // J. Org. Chem. - 2021 - V.86, N. 11, p.7439-7449 - DOI: 10.1021/acs.joc.1c00388
6. Patanen M., Abid A.R., Pratt S.T., Kivimäki A., Trofimov A.B., Skitnevskaya A.D., Grigoricheva E.K., Gromov E.V., Powis I., Holland D.M.P. / Valence shell photoelectron angular distributions and vibrationally resolved spectra of imidazole: A combined experimental-theoretical study // J. Chem. Phys. - 2021 - V.155, N. 5, p.054304(1-16) - DOI: 10.1063/5.0058983
7. Kobychev V.B., Pradedova A.G., Trofimov B.A. / A one-pot assembly of Δ2-isoxazolines from ketones, aryl acetylenes and hydroxylamine: Revisiting the mechanism in terms of quantum chemistry // J. Mol. Struct. - 2021 - V.1246, p.131185(1-11) - DOI: 10.1016/j.molstruc.2021.131185
8. Orel V.B., Manzhueva A.A. / The mechanism of one-pot assembly of tetracyclic derivatives of frontalin from cycloaliphatic ketones and acetylene in KOH/DMSO medium: A quantum-chemical study // Tetrahedron - 2021 - V.89 - DOI: 10.1016/j.tet.2021.132164
9. Absalyamov D.Z., Vitkovskaya N.M. / Quantum-chemical description of interactions in the PhNH2/HCCH system in a superbasic medium // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012049
10. Belogolova A.M., Dempwolff A.L., Dreuw A., Trofimov A.B. / A complex absorbing potential electron propagator approach to resonance states of metastable anions // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012050
11. Bobkov A.S., Vitkovskaya N.M. / Assembly of 1H-pyrrole from cyclopentanone oxime and acetylene: A quantum-chemical model // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012051
12. Gnatovsky G.R., Orel V.B., Vitkovskaya N.M. / The addition of ethylhydrazine to α,β- And β,γ-unsaturated ketones: A quantum-chemical modeling // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012052
13. Grigoricheva E.K., Skitnevskaya A.D., Gromov E.V., Trofimov A.B. / Vibronic coupling in the Pyridine Radical Cation: Nuclear Dynamics Studied Using the Multi-configuration Time-Dependent Hartree method // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012053
14. Kobychev V.B. / Choosing a solvation model for simulating reactions in KOH(KOBut)/DMSO superbasic media // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012054
15. Orel V.B., Vitkovskaya N.M. / Acetylene vs ketones on the route to base-promoted assembly of furans or 6,8-dioxabicyclo[3.2.1]octanes and cyclopentenols: A quantum-chemical study // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012056
16. Pradedova A.G., Kobychev V.B. / Effect of the anionic center hydration on the activation barrier of intramolecular nucleophilic addition in αβ-unsaturated oximes // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012057
17. Teplyashin N.V., Bobkov A.S., Vitkovskaya N.M. / Reaction of N-allenyl-1H-pyrrole-2-yl-carbaldehyde with hydroxylamine: A quantum-chemical model // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012058
18. Zubarev A.A., Orel V.B. / The effect of the reagents nature on nucleophilic addition of acetylenes to the C=N bond of aldimines: A quantum-chemical investigation // J. Phys.: Conf. Ser. - 2021 - V.1847, N. 1 - DOI: 10.1088/1742-6596/1847/1/012059
19. А. Г. Прадедова / Квантовохимическое моделирование стереоселективного образования (E,Z)-1,3-дифенил-2-аза-1,3-диена ИЗ N-бензил-1-фенилэтан-1-имина и ацетилена в суперосновной среде KOBut/ДМСО // Вестник Башкирского университета - 2021 - т.26, №2. - С. 334-339. - DOI: 10.33184/bulletin-bsu-2021.2.10

2020

1. N.M. Vitkovskaya, V.B. Orel, V.B. Kobychev, A.S. Bobkov, D.Z. Absalyamov, B.A. Trofimov / Quantum-chemical models of KOH(KOBut)/DMSO superbasic systems and mechanisms of base-promoted acetylene reactions // Int. J. Quantum Chem. – 2020 – V.120, N. 9 – P. e26152 (1-12) - DOI: 10.1002/qua.26158
2. A.S. Bobkov, N.M. Vitkovskaya, B.A. Trofimov / Cascade Assembly of 4,5,6,7-Tetrahydroindole from Cyclohexanone Oxime and Acetylene in the KOH/DMSO Superbase Medium: A Quantum Chemical Study // J. Org. Chem. – 2020 – V.85, N.10 – P. 6463–6470 - DOI: 10.1021/acs.joc.0c00353
3. N.M. Vitkovskaya, V.B. Orel, D.Z. Absalyamov, B.A. Trofimov / Self-Assembly of N-Phenyl-2,5-dimethylpyrrole from Acetylene and Aniline in KOH/DMSO and KOBu^t/DMSO Superbase Systems: A Quantum-Chemical Insight // J. Org. Chem. – 2020 – V.85, N.16 – P. 10617–10627 - DOI: 10.1021/acs.joc.0c01185
4. V.B. Orel, A.A. Manzhueva / Thermodynamics and isomerism of products and intermediates of a one-pot superbase-promoted assembly of tetracyclic frontalin derivatives: A quantum chemical study // J. Mol. Struct. – 2020 – V. 1215 – P. 128290 – DOI: 10.1016/j.molstruc.2020.128290
5. I.A. Bidusenko, E.Y. Schmidt, I.A. Ushakov, V.B. Orel, D.Z. Absalyamov, N.M. Vitkovskaya, B.A. Trofimov / Head-to-Tail Dimerization of 4-Fluoroacetophenone in the KOH/DMSO Superbase Suspension and Related S_NAr Reaction // Eur. J. Org. Chem. – 2020 - V. 2020, N. 23 - P. 3480-3485 - DOI: 10.1002/ejoc.202000454
6. A.V. Ivanov, S.V. Martynovskaya, V.S. Shcherbakova, I.A. Ushakov, T.N. Borodina, A.S. Bobkov, N.M. Vitkovskaya / Ambient access to a new family of pyrrole-fused pyrazine nitrones via 2-carbonyl-N-allenylpyrroles // Org. Chem. Front. – 2020 – V. 7, N. 24 - P. 4019-4025 -  DOI: 10.1039/d0qo00762e
7. A.L. Dempwolff, A.C. Paul, A.M. Belogolova, A.B. Trofimov, A. Drew / Intermediate state representation approach to physical properties of molecular electron-detached states. I. Theory and implementation // J. Chem. Phys. – 2020 – V.152, N.2 – P.024113 (1-16) - DOI: 10.1063/1.5137792
8. A.L. Dempwolff, A.C. Paul, A.M. Belogolova, A.B. Trofimov, A. Drew / Intermediate state representation approach to physical properties of molecular electron-detached states. II. Benchmarking // J. Chem. Phys. – 2020 – V.152, N.2 – P.024125 (1-12) - DOI: 10.1063/1.5137794
9. A.B. Trofimov,   A.D. Skitnevskaya, E.K. Grigoricheva, E.V. Gromov, H. Köppel / Vibronic coupling in the ground and excited states of the pyridine radical cation // J. Chem. Phys. – 2020 – V.153, N.16 – P. 164307 (1-14) - DOI: 10.1063/5.0024446

2019

1. S.V. Tikhonov, E.V. Fedorenko, A.G. Mirochnik, I.S. Osmushko, A.D. Skitnevskaya, A.B. Trofimov, V.I. Vovna / Spectroscopic and quantum chemical study of difluoroboron β-diketonate luminophores: Isomeric acetylnaphtholate chelates // Spectrochimica Acta - Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy – 2019 – V.214 – P.67-78.
2. B.A. Trofimov, P.A. Volkov, K.O. Khrapova, A.A. Telezhkin, N.I. Ivanova, A.I. Albanov, N.K. Gusarova, A.M. Belogolova, A.B. Trofimov / Acetylene-triggered reductive incorporation of phosphine chalcogenides into a quinoline scaffold: toward S_N^HAr reaction // J. Org. Chem. – 2019 – V.84, N.10 – P.6244-6257.
3. A.B. Trofimov, A.M. Belogolova, S.A. Serebrennikova, R. Forbes, S.T. Pratt, D.M.P. Holland /An experimental and theoretical study of the C 1s ionization satellites in CH₃I // J. Chem. Phys. – 2019 – V.150, N.22 – P.224303 (1-12).
4. N.M. Vitkovskaya, A.S. Bobkov, S.V. Kuznetsova, V.S. Shcherbakova, A.V. Ivanov / Base-promoted formation of an annelated pyrrolo-1,4-oxazine ensemble from 1H-pyrrol-2-ylmethanol and propargyl chloride: a theoretical and experimental study // ChemPlusChem - 2019 doi: 10.1002/cplu.201900407
5. V.B. Orel, N.M. Vitkovskaya, D.Z. Absalyamov, E.Yu. Schmidt, B.A. Trofimov / Quantum chemical comparison of ethynylation and C-vinylation routes in superbase catalyzed reaction of acetylenes with imines // Mendeleev Communications – 2019 - V. 29 - P. 622–624 doi: 10.1016/j.mencom.2019.11.005

2018

1. X. Ren, E. Wang, A. D. Skitnevskaya, A B. Trofimov, K. Gokhberg, A. Dorn, Experimental evidence for ultrafast intermolecular relaxation processes in hydrated biomolecules // Nature Physics – 2018 – V.14 – P.1062-1066.
2. M. Pernpointner, L. Visscher, and A. B Trofimov / Four-component polarization propagator calculations of electron excitations: Spectroscopic implications of spin-orbit coupling effects // J. Chem. Theory Comput. – 2018 – V.14, N.3 – P.1510-1522.
3. V.B. Orel, N.M. Vitkovskaya, V.B. Kobychev, and B.A. Trofimov / Transition-Metal-Free C-Vinylation of Ketones with Acetylenes: A Quantum-Chemical Rationalization of Similarities and Differences in Catalysis by Superbases MOH/DMSO and tBuOM/DMSO (M = Na, K) // J. Org. Chem. – 2018 – V.83, N.7 – P.3719-3726.
4. N.M. Vitkovskaya, V.B. Orel, V.B. Kobychev, E.Yu. Schmidt, and B.A. Trofimov / Two classes of heterocycles – 6,8-dioxabicyclo[3.2.1]octanes and cyclopentenols from the same reagents: a quantum-chemical comparison of mechanism // Int. J. Quantum Chem. – 2018 – e25689 (1-10).
5. A. Trofimov, I. Powis, R. Menzies, D. Holland, E. Antonsson, M. Patanen, C. Nicolas, C. Miron, A. Skitnevskaya, E. Gromov, H. Koeppel, An experimental and theoretical study of the photoelectron spectra of (Z)-1,2-dichloroethene: Valence shell vertical ionization and vibronic coupling in the low-lying states, J. Chem. Phys – 2018 – V.149, N.7 – P.074306 (1-14)
6. I. Powis, R. Menzies, D. Holland, A. Trofimov, A. Skitnevskaya, E. Gromov, E. Antonsson, M. Patanen, C. Nicolas, C. Miron, Photoionization dynamics of cis-dichloroethene from investigation of vibrationally resolved photoelectron spectra and angular distributions, J. Chem. Phys. – 2018 – V.149, N.7 – P.074305 (1-11).
7. S.F. Malysheva, V.A. Kuimov, A.B. Trofimov, N.A. Belogorlova, Yu.I. Litvintsev, A.M. Belogolova, N.K. Gusarova, B.A. Trofimov, 2-Halopyridines in the triple reaction in the P_n/KOH/DMSO system to form tri(2-pyridyl)phosphine: experimental and quantum-chemical dissimilarities // Mendeleev Communications – 2018 – V.28, № 5 – P.472-474.

2017

1. N.M. Vitkovskaya, V.B. Kobychev, A.S. Bobkov, V.B. Orel, E.Y. Schmidt, B.A. Trofimov / Nucleophilic Addition of Ketones To Acetylenes and Allenes: A Quantum-Chemical Insight // J. Org. Chem. — 2017 — V. 82, N. 23. — P. 12467–12476.
2. A.B. Trofimov, D.M.P. Holland, I. Powis, R.C. Menzies, A.W. Potts, L. Karlsson, E. V. Gromov, I.L. Badsyuk, J. Schirmer / Ionization of pyridine: Interplay of orbital relaxation and electron correlation // J. Chem. Phys. — 2017 — V. 146, N. 24.
3. D.M.P. Holland, I. Powis, A.B. Trofimov, R.C. Menzies, A.W. Potts, L. Karlsson, I.L. Badsyuk, T.E. Moskovskaya, E. V Gromov, J. Schirmer / An experimental and theoretical study of the valence shell photoelectron spectra of 2-chloropyridine and 3-chloropyridine // J. Chem. Phys. — 2017. — V. 147, N. 16. — P. 164307.
4. В.Б. Кобычев, В.Б. Орел, Д.В. Занков, Н.М. Витковская, Б.А. Трофимов / Квантово-химическое моделирование катализируемых супероснованием реакций ацетофенона и метилмезитилкетона с ацетиленом // Изв. АН, Сер. хим. — 2017 — N. 12. — P. 2227–2233.
5. А.Б. Трофимов, А.М. Белоголова, Д.Ю. Сошников, Т.Э. Московская, Н.М. Витковская, Б.А. Трофимов / Пропагаторное квантово-химическое исследование S-цис-(Z)-2-(2-формилэтенил)пиррола: электронная структура и аспекты проявления внутримолекулярной водородной связи в спектрах ионизации // Изв. АН, Сер. хим. — 2017 — N. 12. — P. 2241–2247.
6. N. M. Vitkovskaya, V. B. Kobychev, A. D. Skitnevskaya, V. B. Orel, A. S. Bobkov, A. A. Zubarev, and B. A. Trofimov / Synthesis of divinyl sulphide via addition of hydrogen sulfide anion to acetylene in alkaline metal hydroxide/DMSO superbasic system: A quantum-chemical insight // Tetrahedron Lett. – 2017 – Vol. 58, N.1 – P. 92–96.
7. N. M. Vitkovskaya, V. B. Orel, V. B. Kobychev, A. S. Bobkov, E. Yu. Larionova, and B. A. Trofimov / Exploring acetylene chemistry in superbasic media: a theoretical study of water impact on vinylation and ethynylation reactions with acetylene in KOH/DMSO and NaOH/DMSO systems // J. Phys. Org. Chem. – 2017 – N.30. – P. 3669 (1-11) doi: 10.1002/poc.3669.

2016

1. D.N. Tomilin, M.D. Gotsko, L.N. Sobenina, I.A. Ushakov, A.V. Afonin, D.Yu. Soshnikov, A.B. Trofimov, A.B. Koldobsky, B.A. Trofimov / N-Vinyl-2-(trifluoroacetylethynyl)pyrroles and E-2-(1-bromo-2-trifluoroacetylethenyl)pyrroles: Cross-coupling vs. Addition during C-H-functionalization of pyrroles with bromotrifluoroacetylacetylene in solid Al2O3 medium. H-bonding control // J. Fluorine Chem. - 2016. - Vol.186. - P.1–6.
2. D.N. Tomilin, K.B. Petrushenko, L.N. Sobenina, M.D. Gotsko, I.A. Ushakov, A. D. Skitnevskaya, A.B. Trofimov, B.A. Trofimov / Synthesis and optical properties of meso-CF3-BODIPY with acylethynyl substituents in the 3-position of the indacene core // Asian J. Org. Chem - 2016.- Vol. 5, No 10.- P. 1288–1294.
3. D. N. Tomilin, D.Yu. Soshnikov, A.B. Trofimov, M.D. Gotsko, L.N. Sobenina, I.A. Ushakov, A.V. Afonin, A.B. Koldobsky, N.M. Vitkovskaya, B.A. Trofimov / Aluminium oxide-mediated cross-coupling of pyrroles with 1-bromo-2-(trifluoroacetyl)acetylene: a quantum-chemical insight // Mendeleev Commun.- 2016.- Vol. 26. - P. 480–482.
4. B. A. Trofimov, L. V. Andriyankova, L. P. Nikitina, K. V. Belyaeva, A. G. Mal'kina, A. V. Afonin, I. A. Ushakov, V. B. Kobychev, V. M. Muzalevskiy, V. G. Nenajdenko / Reaction of imidazole derivatives with trifluoromethylated arylacetylenes // J. Fluor. Chem.– 2016.–Vol. 188.– P. 157–163.
5. N.M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, V.B. Kobychev, E.Yu. Shmidt, and B.A. Trofimov / Formation mechanism and conformation structure of 2,3,4-trimethyl-1,5-di(thiophen-2-yl)pentane-1,5-dione: quantum chemical study // Russ. Chem. Bull. – 2016. – Vol. 65, No 2 – P. 394–400.

2015

1. N. M. Vitkovskaya, E. Yu. Larionova, A. D. Skitnevskaya, B. A. Trofimov / Hydrative trimerization of acetylene into 2-vinyloxy-1,3-butadiene in the KOH/DMSO system: a quantum chemical insight // Tetrahedron Letters. ­– 2015. – Vol. 56. – P. 1063–1066.
2. В.Б. Кобычев, В.Б. Орел, Н.М. Витковская, Е.Ю. Шмидт, Б.А. Трофимов / Квантовохимическое исследование стереоселективности нуклеофильного присоединения 2-метилциклогексанона к фенилацетилену // Докл. АН.  – 2015 – Т. 461, № 6. – С. 669–672.
3. В.Б. Кобычев, Н.М. Витковская, В.Б. Орел, Е.Ю. Шмидт, Б.А. Трофимов / Квантово-химическое реакций алкил- и арилкетонов с фенилацетиленом под действием супероснования KOH—DMSO // Изв. АН. Сер. хим. – 2015. – № 3 – С. 518–524.
4. D. A. Shabalin, M.Yu. Dvorko, E.Yu. Schmidt, I. A. Ushakov, N.I. Protsuk, V. B. Kobychev, D.Yu. Soshnikov, A.B. Trofimov, N. M. Vitkovskaya, A. I. Mikhaleva, B. A. Trofimov / 3H-Pyrroles from ketoximes and acetylene: synthesis, stability and quantum-chemical insight// Tetrahedron. ­– 2015. – Vol. 71. – P. 3273–3281.
5. D.M.P. Holland, E.A. Seddon, A.B. Trofimov, E.V. Gromov, M. Wormit, A. Dreuw, T. Korona, N. de Oliveira, L.E. Archer, D. Joyeux / A study of the excited electronic states of normal and fully deuterated furan by photoabsorption spectroscopy and high-level ab initio calculations // J. Mol. Spectrosc. - 2015. - Vol. 315.- P. 184-195.
6. M. Schneider, D. Yu. Soshnikov, D. M. P. Holland, I. Powis ,E. Antonsson, M. Patanen, C. Nicolas, C. Miron, M. Wormit, A. Dreuw and A. B. Trofimov / A fresh look at the photoelectron spectrum of bromobenzene: A third-order non-Dyson electron propagator study // J. Chem. Phys. - 2015. - Vol. 143.- P. 144103.
7. I. Powis, D. M. P. Holland, E. Antonsson, M. Patanen, C. Nicolas, C. Miron, M. Schneider, D. Yu. Soshnikov, A. Dreuw and A. B. Trofimov / The influence of the bromine atom Cooper minimum on the photoelectron angular distributions and branching ratios of the four outermost bands of bromobenzene // J. Chem. Phys. - 2015. - Vol. 143.- P. 144304.
8. E. V. Gromov, S. Klaiman, L. S. Cederbaum / Influence of caged noble-gas atom on the superatomic and valence states of  // Mol. Phys.  - 2015. - Vol. 113.- P. 2964-2969.

2014

1. В.Б. Кобычев, Н.М. Витковская. Основы теории групп и ее химические приложения – ООО «Издательство «Аспринт», 2014. – 108 с.
2. Н.М. Витковская, Е.Ю. Ларионова, В.Б. Кобычев, А.Д. Скитневская, Б.А. Трофимов / Квантовохимическое исследование селективности реакций нуклеофильного присоединения метантиола к замещенным ацетиленам в суперосновной среде KOH/DMSO // Докл. АН. – 2014. – Т.456, №5. – С. 549–551.
3. В. Б. Кобычев, В. Б. Орел, Н. М. Витковская, Б.А. Трофимов / Теоретическое исследование реакций ацетона с ацетиленом и фениацетиленом в суперосновной системе KOH/DMSO // Докл. АН. – 2014. – Т.457, №2. – С. 179–181.
4. B.A. Trofimov, L.A. Oparina, O.A. Tarasova, A.V. Artem'ev, V.B. Kobychev,Yu.V. Gatilov, A.I. Albanov, N.K. Gusarova / Tuneable superbase-catalyzed vinylation of α-hydroxyalkylferrocenes with alkynes // Tetrahedron.– 2014.– Vol. 70, Iss. 52 – P. 5954-5960.
5. T. Miteva, S. Klaiman, E.V. Gromov, K. Gokhberg / Ionization satellites of the ArHe dimer // J. Chem. Phys.– 2014.– Vol. 140, Iss. 20 – P. 204320.
6. S. Klaiman, E.V. Gromov, L.S. Cederbaum / All for one and one for all: accommodating an extra electron in C60 // Phys. Chem. Chem. Phys.– 2014.– Vol. 16.– P. 13287–13293.
7. D.M.P. Holland, A.B. Trofimov, E.A. Seddon, E.V. Gromov, T. Korona, N. de Oliveira, L.E. Archer, D. Joyeux, L. Nahon / Excited electronic states of thiophene: high resolution photoabsorption Fourier transform spectroscopy and ab initio calculations // Phys. Chem. Chem. Phys.- 2014.- Vol. 16.- P. 21629-21644.
8. E.V. Gromov / Unveiling the mechanism of photoinduced isomerization of the photoactive yellow protein (PYP) chromophore // J. Chem. Phys. – 2014.– Vol. 141, Iss. 22.– P. 224308.
9. D.M.P. Holland, I. Powis, A.B. Trofimov, I.L. Bodzuk, D.Yu. Soshnikov, A.W. Potts, L. Karlsson / A study of the valence shell electronic structure and photoionisation dynamics of ortho-dichlorobenzene, ortho-bromochlorobenzene and trichlorobenzene // Chem. Phys. – 2014. – Vol. 448 – P. 61-75.

2013

1. А.Б. Трофимов. Введение в квантовую химию: учеб. пособие. – Иркутск : Изд-во ИГУ, 2013. – 192 с.
2. S. Klaiman, E. V. Gromov and L. S. Cederbaum /Extreme Correlation Effects in the Elusive Bound Spectrum of C₆₀^-// J. Phys. Chem. Lett. 4 (2013), 3319-3324
3. Квантово-химическая модель реакции нуклеофильного присоединения метанола и метантиола к ацетилену в суперосновной системе KOH—DMSO / Н. М. Витковская, Е. Ю. Ларионова, А. Д. Скитневская, В. Б. Кобычев, Б. А. Трофимов // Известия АН. Сер. Хим.– 2013, №1.– С. 27–34.
4. A study of the valence shell electronic structure and photoionisation dynamics of meta-dichlorobenzene and meta-bromochlorobenzene // A. Potts, D.M.P. Holland, I. Powis, L. Karlsson, A. Trofimov, I. Bodzuk // Chem. Phys.– 2013.– Vol. 415.– P. 84-97.
5. A study of the valence shell electronic structure and photoionisation dynamics of para-dichlorobenzene and para-bromochlorobenzene / I. Powis, A. Trofimov, I. Bodzuk, D.M.P. Holland, A. Potts, L. Karlsson // // Chem. Phys.– 2013.– Vol. 415.– P. 291-308.
6. Н. М. Витковская, Е. Ю. Ларионова, А. Д. Скитневская, В. Б. Кобычев, Б. А. Трофимов / Квантово-химическое исследование регионаправленности и стереоселективности винилирования метанола замещенными ацетиленами в суперосновной среде KOH/DMSO // Докл. АН. – 2013. – Т.452, №3. – С. 284-286.
7. Н. М. Витковская, Е. Ю. Ларионова, Е.Ю. Шмидт, Б. А. Трофимов / Квантовохимическое исследование термодинамики отдельных стадий реакций: синтеза ацетиленовых спиртов и однореакторной сборки 7-метилен-6,8-диоксабицикло[3.2.1]октанов // Известия АН. Сер. Хим., 2013, №11, С. 2306-2310.

2012

1. Expedient one-step synthesis of nitrogen stilbene analogs by transition metal-free hydroamination of arylacetylenes with pyrroles / M.Yu. Dvorko, E.Yu. Schmidt, T.E. Glotova, D.A. Shabalin, I.A. Ushakov, V.B. Kobychev, K.B. Petrushenko, A.I. Mikhaleva, B.A. Trofimov // Tetrahedron.– 2012.– Vol. 68, Iss. 7.– P. 1963–1971.
2. X-ray spectroscopy of heterocyclic biochemicals: xanthine, hypoxanthine, and caffeine / O. Plekan, V. Feyer, R. Richter, A. Moise, M. Coreno, K. C. Prince, I. L. Zaytseva, T. E. Moskovskaya, D. Yu. Soshnikov, A. B. Trofimov // J. Phys. Chem. A.- 2012.- Vol. 116.- P. 5653-5664.
3. Calculations of nonlinear response properties using the intermediate state representation and the algebraic-diagrammatic construction polarization propagator approach: Two-photon absorption spectra / S. Knippenberg, D. R. Rehn, M. Wormit, J. H. Starcke, I. L. Rusakova, A. B. Trofimov, A. Dreuw // J. Chem. Phys.- 2012.- Vol. 136.- P. 064107/1-15.

2011

1. Взаимодействие метанола с гидроксидами калия и рубидия в диметилсульфоксиде / Н.М. Витковская, Е.Ю. Ларионова, Н.В. Кэмпф, и др. // Журн. структур. химии.– 2011.– Т. 52, № 4.– С. 672–678.
   Methanol interaction with potassium and rubidium hydroxides in dimethyl sulfoxide / N.M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, N.V. Kaempf, V.B. Kobychev, B.A. Trofimov // Journal of Structural Chemistry.– 2011.– Vol. 52, No. 4.– P. 652–658.
2. Взаимодействие метанола, метантиола и ацетоксима с гидроксидами калия и рубидия в диметилсульфоксиде / Н.М. Витковская, Е.Ю. Ларионова, Н.В. Кэмпф, и др. // Журн. структур. химии.– 2011.– Т. 52, № 4.– С. 679–683.
   Interaction of methanol, methanthiol, and acetoxime with potassium and rubidium hydroxides in dimethyl sulfoxide / N.M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, N.V. Kaempf, V.B. Kobychev, A.D. Skitnevskaya, V.B. Orel, B.A. Trofimov // Journal of Structural Chemistry.– 2011.– Vol. 52, No. 4.– P. 659–663. 
3. Теоретическое исследование винилирования метанола, ацетоксима и метантиола ацетиленом в суперосновной каталитической системе KOH/DMSO / Е.Ю. Ларионова, Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев, и др. // Докл. АН.– 2011.– Т. 438, № 6.– С. 1–3.
   A theoretical study of vinylation of methanol, acetoxime, and methanethiol with acetylene in the KOH–DMSO system / E.Yu. Larionova, N.M. Vitkovskaya, V.B. Kobychev, A.D. Skitnevskaya, E.Yu. Shmidt, B.A. Trofimov // Doklady Chemistry.– 2011, Vol. 438, Part 2.– P. 167–169.
4. Теоретическое исследование этинилирования формальдегида ацетиленом в системе KOH – DMSO / Е.Ю. Ларионова, Н.М. Витковская, Н.В. Кэмпф, и др. // Докл. АН.– 2011.– Т. 439, № 1.– С. 1–3.
   A theoretical study of ethynylation of formaldehyde with acetylene in the KOH–DMSO system / E.Yu. Larionova, N.M. Vitkovskaya, N.V. Kempf V.B. Kobychev, B.A. Trofimov // Doklady Chemistry.– 2011, Vol. 439, Part 1.– P. 181–182.
5. Methanol vinylation mechanism in the KOH/DMSO/CH₃OH/C₂H₂ system / N.M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, V.B. Kobychev, et al. // Int. J. QuantumChem. – 2011.– V. 111, No. 11.– P. 2519–2524.
6. Comprehensive core-level study of the effects of isomerism, halogenation, and methylation on the tautomeric equilibrium of cytosine / V. Feyer, O. Plekan, A. Kivimäki, K.C. Prince, T.E. Moskovskaya, I.L. Zaytseva, D.Yu. Soshnikov, A.B. Trofimov // J. Phys. Chem. A.– 2011.– V. 115, No. 26.– P. 7722–7733.
7. Photoinduced isomerization of the photoactive yellow protein (PYP) chromophore: interplay of two torsions, a HOOP mode and hydrogen bonding. / E. V. Gromov, I Burghardt, H. Köppel, S. Cederbaum // J. Phys. Chem. A.– 2011.– V. 115, No. 33.– P. 9237–9248.
8. Ab initio quantum dynamical study of photoinduced ring−opening in furan / E. V. Gromov, C. Lévêque, F. Gatti, I. Burghardt, H. Köppel // J. Chem. Phys.– 2011.– Vol. 135, Iss. 16.– P. 164305-1 – 164305-11.

2010

1. Теоретическое исследование механизма реакции винилирования метанола в системах гидроксид щелочного металла-диметилсульфоксид / Е.Ю.Ларионова, Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев, Б.А. Трофимов // Современные проблемы органической химии, выпуск 15.– СПб, Изд-во "Лема", 2010.– C. 457–466.
2. Неэмпирическое квантово-химическое исследование механизмов реакций в системе C₂H₂/CH₃OH/KOH/ДМСО / Е.Ю. Ларионова, Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев, Б.А. Трофимов // Журн. структур. химии.– 2010.– Т. 51, № 3.– С. 451 – 458.
   An abinitio quantum chemical study of reaction mechanisms in the C₂H₂/CH₃OH/KOH/DMSO system / E.Yu. Larionova, N.M. Vitkovskaya, V.B. Kobychev, B.A. Trofimov // Journal of Structural Chemistry.– 2010.– Vol. 51, No. 3.– P. 428–436
3. Tautomerism in cytosine and uracil: A theoretical and experimental X-ray absorption and resonant Auger study / V. Feyer, O. Plekan, R. Richter, M. Coreno, M. de Simone, K.C. Prince, A.B. Trofimov, I.L. Zaitseva, J. Shirmer // J. Phys. Chem. A.– 2010.– Vol. 114.– P. 10270–10276.
4. An experimental and theoretical study of the valence shell photoelectron spectrum of bromochlorofluoromethane/ D.M.P. Holland, A.W. Potts, L. Karlsson, I. Novak,   I.L. Zaitseva, A.B. Trofimov, E.V. Gromov,  J. Shirmer // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2010.– Vol.43.– P. 135101/1–10.
5. Theoretical study of photoinduced ring-opening in furan / E.V. Gromov, A.B. Trofimov, F. Gatti, H. Koppel1 // J. Chem. Phys.– 2010.– Vol. 133.– P. 164309/1–10.

2009

1. Теоретическая оценка некоторых взаимодействий в системе ацетилен – гидроксид щелочного металла – ДМСО / Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев, Е.Ю. Ларионова и др. // Журн. структур. химии.– 2009.– Т. 50, № 1.– С. 24 – 32.
   E. Yu. Larionova, N. M. Vitkovksaya, V. B. Kobychev, I.L.Zaytseva, B. A. Trofimov, Theoretical evaluation of some interactions in the system of acetylene-alkali metal hydroxide-DMSO // J. Struct. Chem.– 2009.– Vol. 50, No. 1.– P. 18–26.
2. Неэмпирическое квантово-химическое исследование механизма реакции образования этинид-иона в системе C₂H₂/MOH/ДМСО (M = Li, Na, K) / Е.Ю. Ларионова, Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев и др. // Журн. структур. химии.– 2009.– Т. 50, № 1.– С. 33 – 39.
   E.Yu. Larionova, N.M. Vitkovksaya, V.B. Kobychev, N.V. Kaempf, A.D. Skitnevskaya, B.A. Trofimov, Abinitio quantum chemical study of the reaction mechanism of ethynide ion formation in the C₂H₂/MOH/DMSO system (M = Li, Na, K) // J. Struct. Chem.– 2009.– Vol. 50, No. 1.– P. 27–33.
3. V. Feyer, O. Plekan, R. Richter, M. Coreno, G. Vall-llosera, K. C. Prince, A. B. Trofimov, I. L. Zaytseva, T. E. Moskovskaya, E. V. Gromov, J. Schirmer, Tautomerism in cytosine and uracil: An experimental and theoretical core level spectroscopic study // J. Phys. Chem. A.- 2009.- Vol. 113, Iss. 19.- P. 5736-5742.
4. O. Plekan, V. Feyer, R. Richter, M. Coreno, G. Vall-llosera, K. C. Prince, A. B. Trofimov, I. L. Zaytseva, T. E. Moskovskaya, E. V. Gromov, J. Schirmer, An experimental and theoretical core-level study of tautomerism in guanine // J. Phys. Chem. A.- 2009.- Vol. 113, Iss. 33.- P. 9376-9385.
5. I. L. Zaytseva, A. B. Trofimov, J. Schirmer, O. Plekan, V. Feyer, R. Richter, M. Coreno,  K. C. Prince, Theoretical and Experimental Study of Valence-Shell Ionization Spectra of Guanine // J. Phys. Chem. A.- Articles ASAP (As Soon As Publishable), Publication Date (Web): October 2, 2009 (Article).- 8 pages.

2008

1. D.M.P. Holland, A.W. Potts, L. Karlsson, I.L. Zaytseva, A.B. Trofimov, J. Schirmer, A study of the valence shell electronic structure of uracil and the methyluracils // Chem. Phys.– 2008.–V. 353, Iss: 1–3.– P: 47–58.
2. D.M.P. Holland, A.W. Potts, L. Karlsson, I.L. Zaytseva, A.B. Trofimov, J. Schirmer, A study of the valence shell electronic structure of the 5-halouracils // Chem. Phys.– 2008.–V. 352, Iss: 1–3.– P: 205–216.
3. O. Plekan, V. Feyer, R. Richter, M. Coreno, M. de Simone, K. C. Prince, A. B. Trofimov, E. V. Gromov, I. L. Zaytseva, J. Schirmer, A theoretical and experimental study of the near edge X-ray absorption fine structure (NEXAFS) and X-ray photoelectron spectra (XPS) of nucleobases: Thymine and adenine // Chemical Physics.– 2008.– Vol. 347, Iss. 1–3.– P. 360–375.
4. M. Groot, E. Gromov, H. Köppel, W. Buma, High-resolution spectroscopy of methyl 4-hydroxycinnamate and its hydrogen-bonded water complex // J. Phys. Chem. B.– 2008.– Vol. 112, No. 14.– P. 4427–4434.
5. А.Б. Трофимов, И.Л. Зайцева, Т.Э. Московская, Н.М. Витковская, Теоретическое исследование фотоэлектронных спектров фурана, пиррола, тиофена и селенофена // Химия гетероцикл. соединений.– 2008.– № 9.– С. 1366 –1379.
   A. B. Trofimov, I. L. Zaytseva, T. E. Moskovskaya, N.M. Vitkovskaya, Theoretical study of the photoelectron spectra furan pyrrole, thiophene, and selenophene // Chem. Heterocycl. Compd.–2008.– Iss. 9.– P. 1366 –1379.
6. В.Б Кобычев, Н.М. Витковская, Б.А. Трофимов. Теоретическое исследование [1,3]-прототропных перегруппировок оксимов и их эфиров // Журн. структур. химии.– 2008.– Т. 49, № 2.–С. 230–237.
   V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, B.А. Trofimov, Theoretical study of the [1,3]-prototropic rearrangements of oximes and their ethers // Journal of Structural Chemistry.– 2008.– Vol. 49, No. 2.– P. 216-223.
7. Е.Ю. Ларионова, Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев, Н.В. Кэмпф, Б.А. Трофимов, Неэмпирическое квантово-химическое исследование механизма образования метоксид-иона в системах МОН/ДМСО/СН3ОН (М=Li, Na, K) // Журн. структур. химии.– 2008.– Т. 49, № 4.–С. 623–627.
   E.Yu. Larionova, N.M. Vitkovksaya, V.B. Kobychev, N.V. Caempf, B.A. Trofimov, Ab initio quantum-chemical study of the mechanism of methoxide ion formation in MOH/DMSO/CH₃OH systems (M = Li, Na, K) // Journal of Structural Chemistry.– 2008.– Vol. 49, No. 4.– P. 595–599.
8. N. M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, V.B. Kobychev, N.V.Kaempf, B.A.Trofimov, A theoretical study of methanol vinylation reaction mechanism // Int. J. Quantum Chem. – 2008.– Vol.108, No.14.– P. 2630–2635.

2007

1. I. Bâldea, B. Schimmelpfennig, M. Plaschke, J. Rothe, J. Schirmer, A.B. Trofimov, Th. Fanghänel, C 1s near edge X-ray absorption fine structure (NEXAFS) of substituted benzoic acids - A theoretical and experimental study // Journal of Electron Spectroscopy and Related Phenomena.– 2007.– Vol. 154, Iss. 3.– P. 109-118.
2. I. Powis, I. L. Zaytseva, A. B. Trofimov, J. Schirmer, D. M. P. Holland, A. W. Potts, L. Karlsson, A study of the valence shell electronic structure and photoionization dynamics of selenophene // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2007.– Vol. 40.– P. 2019-2041.
3. Free-radical addition of phosphine sulfides to aryl and hetaryl acetylenes: unprecedented stereoselectivity / B.А. Trofimov, S.F. Malysheva, N.K. Gusarova, N.A. Belogorlova, S.F. Vasilevsky, V.B. Kobychev, B.G. Sukhov, I.A. Ushakov // Mendeleev Communs. – 2007.– Vol. 17, No.3.– P. 181–182.
4. A peculiar selective rearrangement during the NiS catalysed dehydrogenation of 4,5-dihydro-1H-benz[g]indole / B.А. Trofimov, A.M. Vasil’tsov, I.A. Ushakov, A.V. Ivanov, E. Yu. Schmidt, A.I. Mikhaleva, N.I. Protsuk, V.B. Kobychev // Mendeleev Communs. – 2007.– Vol. 17, No.5.– P. 296–298.
5. E. V. Gromov, I. Burghardt, J. T. Hynes, H. Köppel, L. S. Cederbaum. Electronic structure of the photoactive yellow protein chromophore: ab initio study of the low-lying excited singlet states // J. Photochem. Photobiol. A.– 2007.– Vol. 190, P. 241-257.
6. E. V. Gromov, I. Burghardt, H. Köppel, L. S. Cederbaum. Electronic structure of the PYP chromophore in its native protein environment // J. Am. Chem. Soc.– 2007, Vol. 129, P. 6798–6806.
7. В.Б. Кобычев, Н.М. Витковская, Е.Ю. Шмидт, Е.Ю. Сенотрусова, Б.А. Трофимов. Неэмпирическое квантовохимическое исследование винилирования пиррола и 2-фенилазопиррола ацетиленом в системе КОН/ДМСО // Журн. структур. химии.– 2007.– Т. 48, приложение.– С. S107–S116.
   V.B. Kobychev, N. M. Vitkovskaya, E. Yu. Shmidt, E. Yu. Senotrusova, B.А. Trofimov, Ab initio quantum-chemical study of vinylation of pyrrole and 2-phenylazopyrrole with acetylene in a KOH/DMSO system // Journal of Structural Chemistry.– 2007.– Vol. 48, Suppl. 1.– P. S100–S110.
8. Е.Ю. Ларионова, Н.М. Витковская, В.Б. Кобычев, Н.В. Шевченко, Б.А. Трофимов. Неэмпирическое квантовохимическое исследование механизмов реакций в суперосновных средах. Некаталитическое винилирование метанола. // Журн. структур. химии.– 2007.– Т. 48, приложение.– С. S101–S106.
   E. Yu. Larionova, N.M. Vitkovskaya, V.B. Kobychev, N. V. Shevchenko, B.А. Trofimov, Ab initio quantum-chemical study of the reaction mechanisms of acetylene in superbasic media. Noncatalytic vinylation of methanol // Journal of Structural Chemistry.– 2007.– Vol. 48, Suppl. 1.– P. S94–S99.

2006

1. M. de Groot, W. J. Buma, E. V. Gromov, I. Burghardt, H. Köppel, L. S. Cederbaum. Combined experimental-theoretical study of the lower excited singlet states of paravinyl phenol, an analog of the paracoumaric acid chromophore // J. Chem. Phys.–2006.– Vol. 125, P. 204303-204319.
2. A. B. Trofimov, J. Schirmer, Molecular ionization energies and ground- and ionic-state properties using a non-Dyson electron propagator approach // J. Chem. Phys.– 2005.– Vol. 123, No. 14.– P. 144115–1-144115–15.
3. A. B. Trofimov, J. Schirmer, V. B. Kobychev, A. W. Potts, D. M. P. Holland, L.Karlsson, Photoelectron spectra of the nucleobases cytosine, thymine and adenine // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2006.– Vol. 39, No. 2.– P. 305-326.
4. A. B. Trofimov, I. L. Krivdina, J. Weller, J. Schirmer, Algebraic-diagram­matic construction propagator approach to molecular response properties // Chem. Phys.– 2006.– Vol. 329, No. 1–3.– P. 1–10.
5. Competitive Deprotonation in Vicinal O=SCH₂CH₂P=O Moieties / N.K. Gusarova, N.A. Chernysheva, S.N. Arbuzova, M.V. Bogdanova, S.F. Malysheva, N.A. Belogorlova, I.A. Ushakov, N.M. Vitkovskaya, V.B. Kobychev, B.A. Trofimov // Letters in Organic Chemistry, 2006, Vol. 3, No. 9.– P. 720–722.

2005

1. A. B. Trofimov, V. G. Zakrzewski, O. Dolgunicheva, J. V. Ortiz, V. F. Sidorkin, E. F. Belogolova, M. Belogolov, V. A. Pestunovich, Silicon-nitrogen bonding in silatranes: assignment of photoelectron spectra // J. Am. Chem. Soc.– 2005.– Vol. 127, No. 3.– P. 986-995.
2. D. M. P. Holland, A. W. Potts, A. B. Trofimov, J. Breidbach, J. Schirmer, R. Feifel, T. Richter, K. Godehusen, M. Martins, A. Tutay, M. Yalcinkaya, M. Al-Hada, S. Eriksson, L. Karlsson, An experimental and theoretical study of the valence shell photoelctron spectrum of tetrafluoromethane // Chem. Phys.– 2005.– Vol. 308, No. 1-2.– P. 43-57.
3. I. Powis, J. D. Thrower, A. B. Trofimov, T. E. Moskovskaya, J. Schirmer, A. W. Potts, D. M. P. Holland, F. Bruhn, L. Karlsson, An experimental and theoretical study of the photoelectron spectrum of hydrogen selenide // Chem. Phys.– 2005.– Vol. 315, No. 1-2.– P. 121-132.
4. K. Gokhberg, A. B. Trofimov, T. Sommerfeld, L. S. Cederbaum, Ionization of metal atoms following valence-excitation of neighbouring molecules // Europhysics Lett. – 2005.– Vol. 72, No. 2.– P. 228-234.
5. E. V. Gromov, I. Burghardt, H. Köppel, L. S. Cederbaum. Impact of sulfur vs oxygen on the low-lying excited states of trans-p-coumaric acid and trans-p-coumaric thio acid // J. Phys. Chem. A.– 2005, Vol. 109, P. 4623-4631.
6. A. B. Trofimov, J. Schirmer, Molecular ionization energies and ground- and ionic-state properties using a non-Dyson electron propagator approach // J. Chem. Phys.– 2005.– Vol. 123, No. 14.– P. 144115–1-144115–15.

2004

1. M. Pernpointner, A. B. Trofimov, The one-particle Green's function method in the Dirac-Hartree-Fock framework. I. Second-order valence ionization energies of Ne through Xe // J. Chem. Phys.– 2004.– Vol. 120, No. 9.– P. 4098-4106.
2. J. Schirmer, A. B. Trofimov, Intermediate state representation approach to physical properties of electronically excited molecules // J. Chem. Phys.– 2004.– Vol. 120, No. 24.– P. 11449-11464.
3. D. M. P. Holland, I. Powis, L. Karlsson, A. B. Trofimov, J. Schirmer, W. von Niessen, A study of the photoionisation dynamics of the cyanogen halides // Chem. Phys.– 2004.– Vol. 297, No. 1-3.– P. 55-73.
4. E. V. Gromov, A. B. Trofimov, N. M. Vitkovskaya, H. Köppel, J. Schirmer, H.-D. Meyer, L. S. Cederbaum, Theoretical study of excitations in furan: Spectra and molecular dynamics // J. Chem. Phys.– 2004.– Vol. 121, No. 10.– P. 4585-4598.
5. H. Köppel, E. V. Gromov, A. B. Trofimov, Multi-mode-multi-state quantum dynamics of key five-membered heterocycles: spectroscopy and ultrafast internal conversion // Chem. Phys.– 2004.– Vol. 304, No. 1-2.– P. 35-49.
6. В.Б.Кобычев, Н.М.Витковская, Н.С.Клыба, Б.А.Трофимов, Неэмпирическое изучение ацетилен-алленовой перегруппировки в 2-пропаргилпирроле, 2-пропаргилфуране и 2-пропаргилтиофене // Журн. структур. химии.– 2004.– 45, № 1.– С. 7–12.
   V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, N.S. Klyba, B.A.Trofimov, Ab Initio Study of the Acetylene–Allene Rearrangement in 2-Propargylpyrrole, 2-Propargylfuran, and 2-Propargylthiophene // Journal of Structural Chemistry.–2004.– 45 (1): 5-11.
7. В.Б. Кобычев, Н.В. Павлова, Исследование механизма миграции двойной связи в аллильной системе с участием гидроксид-иона. 1. Газовая фаза и модель Борна-Онзагера. // Журн. структур. химии. – 2004.– 45, № 1.–С. 13–21.
   V.B. Kobychev, N.V. Pavlova, Double Bond Migration Mechanism in Allyl Systems Involving the Hydroxide Ion. 1. Gas-Phase and Born–Onsager Models // Journal of Structural Chemistry 45 (1): 12-19
8. В.Б. Кобычев, Исследование механизма миграции двойной связи в аллильной системе с участием гидроксид-иона. 2. Модели поляризуемого диэлектрика (РСМ) // Журн. структур. химии. – 2004.– 45, № 1.–С. 22–30.
   V.B. Kobychev, Double Bond Migration Mechanism in Allyl Systems Involving the Hydroxide Ion. 2. Polarizable Continuum Model (PCM) // Journal of Structural Chemistry 45 (1): 20-27
9. В.Б. Кобычев, Исследование механизма миграции двойной связи в аллильной системе с участием гидроксид-иона. 3. Приближение супермолекулы // Журн. структур. химии. – 2004.– 45, № 1.–С. 31–38.
   V.B. Kobychev, Double Bond Migration Mechanism in Allyl Systems Involving the Hydroxide Ion. 3. Supermolecular Approach // Journal of Structural Chemistry 45 (1): 28-35
10. В.Б.Кобычев, Н.М.Витковская, И.Л.Зайцева, Б.А.Трофимов, Квантовохимическое исследование профилей образования N-аддуктов аниона пиррола с CS₂ и CO₂ // // Журн. структур. химии. – 2004.– 45, № 6.–С. 990–993.
    V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, I.L. Zaytseva, B.A. Trofimov Quantum-Chemical Study of the Profiles of Reactions that Form Pyrrole Anion N-Adducts with CS2 and CO2 // Journal of Structural Chemistry.– 2004.– Vol. 45, No. 6.– P. 940–944.
11. В.Б.Кобычев, Н.М.Витковская, Н.В.Павлова, Е.Ю.Шмидт, Б.А.Трофимов, Теоретический анализ и экспериментальное исследование пространственного строения и изомерии азина ацетона и его циклизации в 3,5,5-триметил-1Н-пиразол // Журн. структур. химии.– 2004.– Т. 45, № 5.– С. 792–799.
    V. B. Kobychev, N. M. Vitkovskaya, N. V. Pavlova, E. Yu. Schmidt, B. A. Trofimov, Theoretical Analysis and Experimental Study of the Spatial Structure and Isomerism of Acetone Azine and Its Cyclization to 3,5,5-Trimethyl-4,5-dihydro-1H-pyrazole // Journal of Structural Chemistry.– 2004.– Vol. 45, No. 5.– P. 748–755.
12. V.B.Kobychev, N.M.Vitkovskaya, B.A.Trofimov, Theoretical study of the double bond migration mechanism with a participation of hydroxide ion // Int. J. Quantum Chem.– 2004.– V.100, No. 4.– P. 367–374.
13. V.B.Kobychev, N.M.Vitkovskaya, I.L.Zaytseva, B.A.Trofimov, Pyrrole anion addition to carbon disulfide: an ab initio study // Int. J. Quantum Chem.– 2004.– V. 100, No. 4.– P. 360–366.

2003

1. E. V. Gromov, A. B. Trofimov, N. M. Vitkovskaya, J. Schirmer, H. Köppel, Theoretical study of the low-lying excited singlet states of furan // J. Chem. Phys.– 2003.– Vol. 119, No. 2.– P. 737-753.
2. A. W. Potts, D. M. P. Holland, A. B. Trofimov, J. Schirmer, L. Karlsson, K. Siegbahn, An experimental and theoretical study of the valence shell photoelectron spectra of purine and pyrimidine molecules // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2003.– Vol. 36, No. 14.– P. 3129-3141.
3. A. B. Trofimov, E. V. Gromov, H. Köppel, J. Schirmer, K. C. Prince, R. Richter, M. De Simone, M. Coreno, A theoretical study of the 1B1(O1s®*) and 1A1(O1s®3s) excited states of formaldehyde // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2003.– Vol. 36, No. 18.– P. 3805-3816.

2002

1. D. M. P. Holland, A. W. Potts, L. Karlsson, A. B. Trofimov, J. Schirmer, The influence of shape resonance phenomena on the valence shell photoionization dynamics of silicon tetrafluoride // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2002.– Vol. 35, No. 7.– P. 1741-1757.
2. A. B. Trofimov, J. Schirmer, D. M. P. Holland, A. W. Potts, L. Karlsson, R. Maripuu, K. Siegbahn, The influence of electron correlation and relativistic effects on the valence shell photoelectron spectrum of iodothiophene // J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.– 2002.– Vol. 35, No. 24.– P. 5051-5079.
3. A. B. Trofimov, G. Stelter, J. Schirmer, Electron excitation energies using a consistent third-order propagator approach: Comparison with full configuration interaction and coupled cluster results // J. Chem. Phys.– 2002.– Vol. 117, No. 14.– P. 6402-6410.
4. В.Б.Кобычев, Н.М.Витковская, Н.С.Клыба, Б.А.Трофимов. Неэмпирическое квантово-химическое исследование ацетилен-алленовой перегруппировки пропаргильных систем X–CH₂–CºCH (X = H, Me, NMe₂, OMe, F, SMe) // Изв. АН, Сер. хим., 2002, № 5, 713-720.
   V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, N.S. Klyba, B.A.Trofimov, Acetylene-allene reaarangement of propargyl systems X–CH2–CºCH (X = H, Me, NMe2, OMe, F, SMe): an ab initio study // Russ. Chem. Bull., 2002, 51 No. 5, 774-782.
5. V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, I.L. Zaytseva, E.Yu. Larionova, B.A. Trofimov. Theoretical analysis of pyrrole anions addition to carbon disulfide and carbon dioxide // Int. J. Quantum Chem., 2002, 88 No. 5, 542-548.
6. V.B. Kobychev, N. M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, B.A. Trofimov, Sulfur Versus Oxygen in Interaction with the Double Bond: Ab Initio Study of Electronic Structure and Prototropic Rearrangement of 1-Methoxy-2-propene and 1-Methylthio-2-propene, // Phosphorus, Sulfur, Silicon and Relat. Elem., 2002, 177 No. 12, 2931 - 2940.

2001

1. A. B. Trofimov, J. Schirmer, D. M. P. Holland, L. Karlsson, R. Maripuu, K. Siegbahn, A. W. Potts, An experimental and theoretical investigation of the valence shell photoelectron spectra of thiophene, 2-chlorothiophene and 3-chlorothiophene // Chem. Phys.– 2001.– Vol. 263, No. 1.– P. 167-193.
2. A. W. Potts, A. B. Trofimov, J. Schirmer, D. M. P. Holland, L. Karlsson, An experimental and theoretical investigation of the valence shell photoelectron spectra of 2-bromothiophene and 3-bromothiophene // Chem. Phys.– 2001.– Vol. 271, No. 3.– P. 337-356.
3. M. S. Deleuze, A. B. Trofimov, L. S. Cederbaum, Valence one-electron and shake-up ionization bands of polycyclic aromatic hydrocarbons. I. Benzene, naphthalene, anthracene, naphthacene, and pentacene // J. Chem. Phys.– 2001.– Vol. 115, No. 13.– P. 5859-5882.
4. M. G. Giuffreda, M. S. Deleuze, J.-P. François, A. B. Trofimov, Polarization propagator study of the valence electron excitation of linear carbon clusters C3, C5 and C7 // Int. J. Quantum Chem.– 2001.– Vol. 85, No. 4-5.– P. 475-491.
5. A. B. Trofimov, T. E. Moskovskaya, E. V. Gromov, H. Köppel, J. Schirmer, Theoretical study of K-shell excitations in formaldehyde // Phys. Rev. A.– 2001.– Vol. 64, No. 2.– P. 022504–1-022504–15.
6. B.A.Trofimov, N.M.Vitkovskaya, V.B.Kobychev, E.Yu.Larionova, L.N.Sobenina, A.I.Mikhaleva, A.P.Demenev, Addition of pyrrole anions to carbon disulfide. Theoretical analysis // Sulfur Letters, – 2001, Vol. 24, No. 4, – P. 181-190.
7. В.Б.Кобычев, Н.М.Витковская, И.Л.Зайцева, Е.Ю.Ларионова, Б.А.Трофимов, Неэмпирическое квантовохимическое исследование реакции пиррольных анионов с сероуглеродом, // Журн. структур. химии, – 2001, – Т. 42, № 4, – С. 645-653.
   V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, I.L. Zaytseva, E.Yu. Larionova, B.A. Trofimov, Ab initio Study of the Reaction of Pyrrole Anions with Carbon Disulfide // Journal of Structural Chemistry.–2004.– 45 (4): 536–543.

2000

1. А. Б. Трофимов, Т. Э. Московская, Е. В. Громов, Н. М. Витковская, И. Ширмер, Электронные спектры остовных уровней в приближении ADC(2) для поляризационного пропагатора: молекулы моноксида углерода и азота // Журн. структур. химии.– 2000.– Т. 41, № 3.– С. 590-604.
2. W. N. Pang, J. F. Gao, C. J. Ruan, R. C. Shang, A. B. Trofimov, M. S. Deleuze, Valence electron momentum spectroscopy of n-butane // J. Chem. Phys.– 2000.– Vol. 112, No. 18.– P. 8043-8052.
3. D. M. P. Holland, D. A. Shaw, L. Karlsson, L. G. Shpinkova, L. Cooper, A. B. Trofimov, J. Schirmer, An experimental and theoretical investigation of the valence shell photoelectron spectrum of cyanogen chloride // Molecular Physics.– 2000.– Vol. 98, No. 23.– P. 1939-1947.
4. A. B. Trofimov, E. V. Gromov, T. E. Moskovskaya, J. Schirmer, Theoretical evidence for a bound doubly-excited ¹B₂(C1s,n®p^*2) state in H₂CO below the C1s ionization threshold // J. Chem. Phys.– 2000.– Vol. 113, No. 16.– P. 6716-6723.
5. В.Б. Кобычев, Н.М. Витковская, Е.Ю. Ларионова, Н.С. Клыба, Б.А. Трофимов, Миграция кратной связи с участием протофильной частицы. Сообщение 4. Сравнительное исследование миграции двойной связи в 3-метилтиопроп-1-ене и 3-метоксипроп-1-ене // Изв. АН, Сер. хим., – 2000, № 3, – С. 407-413.
   V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, N.S. Klyba, B.A.Trofimov, Multiple bond migration with participation of a protophilic agent. 4. Double bond migration in 3-methyithioprop-1-ene and 3-methoxyprop-1-ene: a comparative study // Russ. Chem. Bull. – 2000. – Vol. 49, No. 3. – P. 408-414.
6. В.Б. Кобычев, Н.М. Витковская, Е.Ю. Ларионова, Б.А. Трофимов, Миграция кратной связи с участием протофильной частицы. Сообщение 5. Миграция двойной связи в гетероаллильных системах, // Изв. АН, Сер. хим., – 2000, №3, – С. 414-419.
   V.B. Kobychev, N.M. Vitkovskaya, E.Yu. Larionova, B.A.Trofimov, Multiple bond migration with participation of a protophilic agent. 5. Double bond migration in heteroallylic systems // Russ. Chem. Bull. – 2000, – Vol. 49, No. 3, – P. 415-420.