Nous avons précédemment annoncé que l’Université d’État d’Irkoutsk a été classée parmi le top 10 des universités en termes de nombre de lauréats du concours de la Fondation Potanine pour les professeurs des programmes de master. Quatre représentants de l’UÉI sont devenus bénéficiaires de subventions.

Aujourd’hui, nous présentons le projet d’Ivan Petrouchine, candidat en sciences techniques, maître de conférences au département des disciplines scientifiques naturelles de la Faculté de communication commerciale et d’informatique – « Modernisation du cours sur l’application des outils de bio-informatique pour analyser des données génomiques » ;

Ivan Petrouchine :

Le programme de master de l’Institut des mathématiques et technologies de l’information de l’UÉI, spécialisation « Analyse des données des expériences scientifiques et apprentissage automatique », inclut un cours « Bioinformatique ». Au cours des cinq années d’existence de ce programme, de nouvelles méthodes sont apparues dans le domaine, les technologies d’intelligence artificielle ont pris une place importante, et nous avons décidé de mettre à jour ce programme. Dans l’équipe du projet, avec moi, sont : Daria Gutnik, doctorante de l’Institut de limnologie de la division sibérienne de l’Académie des sciences de Russie, ainsi que Igor Gorbenko, diplômé du programme de master mentionné ci-dessus, candidat en sciences biologiques et chercheur junior à l’Institut sibérien de physiologie et biochimie des plantes de la division sibérienne de l’Académie des sciences de Russie. Ensemble, nous menons plusieurs travaux de recherche et utilisons constamment les outils de la bioinformatique dans notre travail.

Le programme modernisé vise à permettre aux étudiants d’apprendre à utilizer un large éventail d’outils de bioinformatique et de bibliothèques spécialisées pour le traitement et l’interprétation des données génomiques en langages R et Python.

Le cours est prévu pour des étudiants du programme de master « Analyse des données des expériences scientifiques et apprentissage automatique », mais les unités du cours peuvent également être utilisées pour la formation des étudiants du troisième cycle et la création de programmes de recyclage. Le domaine de la biologie computationnelle et de la bioinformatique est étroitement lié à la biomédecine, à la sélection, à l’écologie et à la biotechnologie.

Des cours similaires sont pratiquement absents dans des programmes des universités russes. Pour étudier les outils de la bioinformatique, il existe généralement des programmes de master spécialisés dans lesquels ces sujets sont répartis sur plusieurs disciplines. La formation dans ces programmes exige des connaissances dans le domaine spécifique (biologie moléculaire et génétique).

Le cours comprendra six unités contenant des vidéos avec des conférences et des instructions pour les travaux pratiques. Ce format permet d’étudier le cours à distance avec un enseignant, ainsi qu’en auto-apprentissage.