伊尔库茨克国立大学是亚欧国际大学联合成员、东北亚大学校长会议参与者、俄罗斯商学教育联盟成员，同时也是世界银行学院的合作伙伴。累计共与欧洲以及亚洲的学校签署63份合同文件。伊尔库茨克大学积极与辽宁大学（中国）、亚当∙密茨凯维奇大学（波兰）、克里斯蒂安-阿尔伯特基尔大学 （德国）、薩伏依大学（法国）、北海道大学（日本）、蒙古国立大学等国外的大学以及科学研究中心合作。学校共有来自中国、蒙古、韩国、德国、美国、奥地利、越南、阿富汗等国以及独联体国家的约450名留学生。
伊尔库茨克国立大学孔子学院是伊尔库茨克州以及后贝加尔湖唯一一所能颁发汉语水平测试证书的机构。该证书视为考入中国大学所需要的必要证明。在与韩国外交部韩国基金委的合作下，伊尔库茨克国立大学得以加入韩国管理大学俄罗斯联盟。该联盟除伊尔库茨克国立大学以外在俄罗斯还有五所主要的大学 （莫斯科国立大学、圣彼得堡国立大学、远东国立大学、远东国立人文大学、新西伯利亚国立大学）。
在伊尔库茨克国立大学有一个联合国教科文组织水研究室，它隶属于类似国际教研室协作体系，从2006年开始伊尔库茨克国立大学牛津奖学金体系中20个国家高等学府之一。从2008年开始伊尔库茨克国立大学参加了国际教育大纲«ErasmusMundus：对外合作窗口»。
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